Els programes de doctorat que s'han ofert durant el curs 2011-2012 a la UPF han estat els següents:
- Biomedicina
- Ciències Polítiques i Socials
- Comunicació Social
- Comunicació Lingüística i Mediació Multilingüe
- Dret
- Economia, Finances i Empresa
- Història
- Humanitats
- Tecnologies de la Informació, les Comunicacions i els Mitjans Audiovisuals
