La Universitat Pompeu Fabra ha ofert dos programes de doctorat segons el RD 778/1998 i nou programes segons el RD 1393/2007.
| Àrea | De Periodisme i de Comunicació Audiovisual |
| Nom del programa | Teoria, Anàlisi i Documentació Cinematogràfica |
| Edició | 2007-2009 |
| Departament responsable | Comunicació |
| Directora | Núria Bou i Sala |
| Nombre de crèdits | 32 |
| Nombre d'alumnes matriculats | 27 |
| Àrea | De Periodisme i de Comunicació Audiovisual |
| Nom del programa | Comunicació Pública |
| Edició | 2007-2009 |
| Departament responsable | Comunicació |
| Director | Javier Díaz Noci |
| Nombre de crèdits | 32 |
| Nombre d'alumnes matriculats | 15 |
| Nom del programa | Biomedicina |
| Departament responsable | Ciències Experimentals i de la Salut |
| Director | David Comas Martínez |
| Nombre de crèdits | 20 |
| Nombre d'alumnes matriculats | 60 |
| Nom del programa | Tecnologies de la Informació, la Comunicació i els Mitjans Audiovisuals |
| Departament responsable | Tecnologies de la Informació i les Comunicacions (en constitució) |
| Director | Marcelo Beltarmio Barate |
| Nombre de crèdits | 20 |
| Nombre d'alumnes matriculats | 24 |
| Nom del programa | Comunicació Lingüística i Mediació Multilingüe |
| Departament responsable | Traducció i Filologia |
| Director | Enric Vallduví |
| Nombre de crèdits | 5 |
| Nombre d'alumnes matriculats | 19 |
| Nom del programa | Política i Societat |
| Departament responsable | Ciències Polítiques i Socials |
| Director | Klaus Jurgen Nagel |
| Nombre de crèdits | 20 |
| Nombre d'alumnes matriculats | 16 |
| Nom del programa | Humanitats |
| Departament responsable | Humanitats |
| Directora | Victòria Cirlot |
| Nombre de crèdits | 20 |
| Nombre d'alumnes matriculats | 4 |
| Nom del programa | Història |
| Departament responsable | Institut Universitari d'Història Jaume Vicens i Vives |
| Director | Josep M. Delgado Ribas |
| Nombre de crèdits | 20 |
| Nombre d'alumnes matriculats | 6 |
| Nom del programa | Comunicació Social |
| Departament responsable | Comunicació |
| Directors | Javier Díaz Noci / Núria Bou |
| Nombre de crèdits |
20 |
|
Nombre d'alumnes matriculats |
82 |
| Nom del programa | Economia, Finances i Empresa |
| Departament responsable | Economia |
| Director | Jaume Ventura |
| Nombre de crèdits | 20 |
| Nombre d'alumnes matriculats | 65 |
| Nom del programa | Dret |
| Departament responsable | Dret |
| Director | José Luis Pérez Triviño |
| Nombre de crèdits | 20 |
| Nombre d'alumnes matriculats | 51 |