Lliure elecció

Biologia Teòrica(82387) 

Introducció

Aquest curs introdueix els alumnes dins el camp de la teoria en biologia, amb especial atenció a la modelització amb ordinador i a la formulació de models senzills en diferents camps, des de la dinàmica dels virus de RNA, el plegament de proteïnes o el càncer fins a l'arquitectura del genoma.

Objectius generals

Proporcionar una visió de l'aproximació teòrica als sistemes biològics complexos i com formular models simples amb potència explicativa.
Mostrar la importància de la biologia integrativa per abordar i comprendre la complexitat biològica a diferents escales: veurem com sovint els detalls importants a certa escala no ho són en moure'ns a una escala més gran.
Explorar els conceptes básics amb l'ajut d'exemples rellevants que es presentaran de forma descriptiva, formulant les preguntes obertes i intentant respondre amb l'ajut de models teòrics.
Explorar el paper que han jugat al llarg de l'evolució la selecció natural i les propietats universals i com cal tenir-les en compte a l'hora de comprendre les estructures funcionals que observem. 

Continguts

Tema 1

Models en biologia. 

Tema 2

Evolució i generació d'estructures biològiques: la importància dels punts crítics. 

Tema 3

Sistemes dinàmics i modelització bàsica. 

Tema 4

Autoorganització i propietats universals. 

Tema 5

Xarxes complexes, mons petits i homeòstasi. 

Tema 6

Xarxes cel·lulars: genoma, proteoma i metaboloma. 

Tema 7

Virus i quasiespècies: la catàstrofe d'error. 

Tema 8

Càncer i inestabilitat genòmica. 

Tema 9

Xarxes ecològiques: orígens de la fragilitat i la biodiversitat. 

Tema 10

Xarxes neutrals:ontogènia i complexitat. 

Tema 11

Xarxes en el llenguatge humà. 

Avaluació i requisits

L'assignatura està adreçada a estudiants de biologia de qualsevol curs. S'impartirà durant el segon trimestre, tres hores per setmana. L'avaluació es farà a partir d'un seguiment de l'activitat dels alumnes i, fonamentalment, a partir d'un treball de curs, que implicarà la realització d'un model o bé un estudi de dades que permetin formular un model.